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3.1.添加SPC后,微環(huán)境發(fā)生了變化
為了研究添加SPC對微環(huán)境的瞬時(shí)影響,在添加SPC劑量后3小時(shí),測試環(huán)境變量,包括pH、ORP和溶解物質(zhì)。圖1a顯示硫酸鹽、碳酸鹽、DOC和pH的量隨著(zhù)SPC劑量的增加而增加,且增量與SPC劑量呈線(xiàn)性相關(guān)。相反,ORP降低,ORP降低與SPC劑量呈線(xiàn)性相關(guān)。
圖1。加入SPC后,環(huán)境變量發(fā)生變化。(a)SPC劑量與環(huán)境變量增減的關(guān)系;(beh)隨著(zhù)SPC劑量的不同,環(huán)境變量在不同時(shí)期發(fā)生變化(基于鄧肯檢驗,采用SPSS中的雙向方差分析對顯著(zhù)差異進(jìn)行檢驗;大寫(xiě)字母表示不同時(shí)期一種治療的差異,小寫(xiě)字母表示同一時(shí)期不同治療之間的差異,n?3,a?0.05)。
基于這些結果,對于以下結果,使用對照(C)、低(L)、中(M)和高(H)微宇宙來(lái)表示空白對照和三劑量SPC(11.2,22.4,和33.6毫摩爾SPC G-1濕沉積物)。圖1b-h顯示加入SPC后微觀(guān)環(huán)境變量的趨勢不同。首先,pH值在第15天下降,之后保持穩定。第二,ORP在第15天下降,之后緩慢上升。第三,碳酸鹽和DOC在第15天增加,但在第37天顯著(zhù)減少,之后保持穩定。此外,在使用SPC處理的所有微觀(guān)世界中,磷酸鹽在第15天顯著(zhù)增加,而在L水平處理中減少,在第37天M和H微觀(guān)世界中增加。然而,添加SPC后的硫酸鹽在第15天降至C微觀(guān)結構的水平,在第50天降至C微觀(guān)結構的值以下;在第15天,L、M和H微觀(guān)結構中的銨含量超過(guò)了C微觀(guān)結構中的銨含量。
3.2.添加SPC后微生物群落的潛在代謝活性
圖2a顯示了Biolog生態(tài)板的AWCD,用于描述本地微生物群落的潛在代謝活動(dòng)。在第0天和第15天,四種處理的AWCD曲線(xiàn)顯示出相似的模式,L、M和H微觀(guān)世界的值超過(guò)了C微觀(guān)世界的值。在第37天和第50天,AWCD曲線(xiàn)的模式發(fā)生變化,在M和H微觀(guān)世界中呈現“S”形。
圖2。在不同時(shí)期(n?3),對照和SPC處理中所有六組碳源(b)的AWCD曲線(xiàn)(a)和潛在活性(b)。
此外,ECO板的31個(gè)碳源分為六組(Pan等人,2015),包括兩種胺/酰胺、六種氨基酸、七種碳水化合物、九種羧酸、四種聚合物和三種其他碳源。圖2b顯示了ECO板在84 h時(shí)所有六種類(lèi)別的平均吸光度。顯然,在羧酸和聚合物基團中,SPC處理和C基團之間未發(fā)現顯著(zhù)差異;然而,其他四組在不同時(shí)期存在差異。在碳水化合物組中,M和H微觀(guān)結構的平均吸光度顯著(zhù)增加。此外,雜類(lèi)組在第0天和第15天在M微觀(guān)世界中顯著(zhù)增加,在第15天在H微觀(guān)世界中顯著(zhù)增加。氨基酸組僅在第37天M微觀(guān)世界中顯著(zhù)增加。相反,在胺/酰胺組中,H微觀(guān)世界的平均吸光度在第37天顯著(zhù)降低,M微觀(guān)世界在第50天顯著(zhù)降低。
3.3.添加SPC后本地微生物群落的分類(lèi)組成和功能群
根據ANOSIM、ADONIS和MRPP分析(表S2),在每個(gè)時(shí)期觀(guān)察到所有樣本的顯著(zhù)差異(R>0、R2>0、d>0,均p<0.01)。表1總結了C和SPC處理的微生物群落的α多樣性。Shannon指數和Simpson指數表明C、L和M微觀(guān)世界之間沒(méi)有顯著(zhù)差異,而H微觀(guān)世界中的差異顯著(zhù)。在第15、37和50天,H微觀(guān)世界中的潮-1和均勻度顯著(zhù)降低;然而,在L微觀(guān)世界中,這些指數僅在第15天顯著(zhù)降低。此外,NMDS結果顯示H水平處理與其他處理之間存在明顯的距離(圖3A)。
表1不同時(shí)期對照和SPC處理微生物群落的α多樣性分析。
圖3B、C和D顯示了門(mén)、類(lèi)和屬級別的微生物群落的分類(lèi)組成。在門(mén)級別(圖3B),微生物群落結構主要由九門(mén)組成。在H微觀(guān)世界中,擬桿菌和厚壁菌明顯促進(jìn)并代表優(yōu)勢門(mén),同時(shí)抑制鈣地霉、氯曲菌、酸性細菌和變形菌。在M微觀(guān)世界中,鈣質(zhì)細菌和酸性細菌受到抑制。除了在第15天,L和C微觀(guān)世界中的氯屈曲增加和變形菌和鈣地霉減少外,L和C微觀(guān)世界顯示出相似的分布。圖3C顯示了相對豐度超過(guò)1%的類(lèi)別。結果表明,在任何時(shí)候接受SPC處理的微觀(guān)世界中,鈣中毒都有所減少。在H微觀(guān)世界中,嗜酸桿菌、Holophagae、Caldiserica和Deltaproteobacteria急劇減少,而梭狀芽孢桿菌顯著(zhù)增加。在M微觀(guān)世界中,α變形菌在第37天和第50天急劇增加,同時(shí)鈣質(zhì)減少。
圖3。微生物群落結構分析。(A)?;贐ray-Curtis距離的NMDS排序圖;(B)門(mén)的分布(相對豐度)≥1%);(C)類(lèi)別分布(相對豐度)≥1%);(D)屬水平的熱圖和聚類(lèi)分析(顯示為類(lèi)/屬水平)(相對豐度)≥0.1%,對數10標度);(E)微生物群落功能群的相對豐度(任何示例的相對豐度>1.5%)。
在屬水平上,獲得了37個(gè)屬(相對豐度)≥1.0%)和雙聚類(lèi)分析的熱圖(hclust)用于描述其差異(圖3D)。聚類(lèi)結果表明,M微觀(guān)世界中的屬與H微觀(guān)世界中的屬更相似,而與L和C微觀(guān)世界中的屬更相似。此外,37個(gè)屬可分為三類(lèi):HA(高豐度,從B7到B16)、MA(中等豐度,從B17到B37)和LA(低豐度,從B1到B6)。在HA組中,10屬代表了C微觀(guān)世界中的優(yōu)勢類(lèi)群,其中大部分屬于Deltapoteobacteria類(lèi),僅在H微觀(guān)世界中減少。其他處理效果不明顯。在馬,屬屬于各種類(lèi)型的類(lèi)。在第15、37和50天,WCHB1-69家族中的B17硫曲菌屬和B18屬在M和H微觀(guān)世界中均明顯減少,而在第15、37和50天,Coriobacteriae家族中的B19苯桿菌屬、B20溶桿菌屬和B21屬增加。從B26到B30的細菌在H微觀(guān)世界中明顯減少。在第15天、第37天和第50天,H和M微觀(guān)世界中的LA屬增加,尤其是B5 Petrimonas和B6 Proteininclasticum。在第37天和第50天,M微觀(guān)世界中的B4短枝單胞菌明顯增加。
圖3E顯示了自然微生物群落的前八個(gè)功能組(相對豐度>1.5%,詳細數據和其他組如表S4所示)對時(shí)間和SPC劑量的響應。在H微觀(guān)世界中,能夠進(jìn)行化學(xué)異養、發(fā)酵、需氧化學(xué)異養、尿素分解和殼聚糖分解的微生物在整個(gè)取樣時(shí)間內增加。能夠進(jìn)行硫酸鹽呼吸和硫化合物呼吸的微生物在第0天增加,之后開(kāi)始減少。能夠暗氧化含硫化合物的微生物在第0天減少,在第15、37和50天增加。除了能夠呼吸硫化物的微生物外,在M微觀(guān)世界中,硫酸鹽呼吸和硫化物的暗氧化在第50天減少。其他六組隨時(shí)間增加。在L微觀(guān)世界中,八組的順序保持不變,盡管它們在第50天減少。
3.4.添加SPC后微生物群落的環(huán)境變量、所考慮的屬和功能組之間的關(guān)系
圖4A顯示了八個(gè)功能群與37個(gè)屬之間的顯著(zhù)spearman相關(guān)性(p<0.05)。一方面,能夠發(fā)酵和化學(xué)異養的微生物與Petrimonas屬、嗜蛋白菌屬、苛孢霉屬、破蛋白菌屬和未培養的細菌呈梭狀芽孢桿菌的順序呈強正相關(guān)(系數>0.6)。能夠解脲的微生物與蛋白碎屑菌和梭菌的順序呈強正相關(guān)。此外,能夠進(jìn)行幾丁質(zhì)分解的微生物與苯桿菌、溶桿菌和短桿菌密切正相關(guān)。此外,能夠進(jìn)行硫酸鹽呼吸和硫化合物呼吸的微生物與聯(lián)營(yíng)養菌、聯(lián)營(yíng)養菌、聯(lián)營(yíng)養菌和聯(lián)營(yíng)養菌科細菌密切正相關(guān)。另一方面,能夠發(fā)酵和化學(xué)異養的微生物與Smithella、Caldisericum以及不同類(lèi)別(B28和B30)和不同家族(B29、B32和B18)的細菌具有強烈的負相關(guān)。能夠解脲的微生物與史密氏菌和OPB35類(lèi)細菌呈強烈的負相關(guān)。
圖4。添加SPC后,環(huán)境變量、所考慮的屬和官能團之間的相關(guān)性分析。(A)功能群與所考慮屬之間的Spearman相關(guān)分析;(B)顯示了環(huán)境變量和考慮的功能組之間的spearman相關(guān)分析(顯著(zhù)相關(guān)(p<0.05),藍色和紅色圓圈分別表示正相關(guān)和負相關(guān),行和列用hclust聚集;*表示系數大于0.6或小于0.6);(C)基于環(huán)境變量和37個(gè)屬的RDA分析。(有關(guān)此圖例中顏色參考的解釋?zhuān)堊x者參考本文的Web版本。)
圖4B顯示了環(huán)境變量和功能組之間的顯著(zhù)spearman相關(guān)性;表明大多數環(huán)境變量與功能組呈正相關(guān)。簡(jiǎn)單地說(shuō),硫酸鹽主要與硫酸鹽呼吸和硫化物呼吸密切正相關(guān)。DOC、碳酸鹽和磷酸鹽與發(fā)酵、化學(xué)異養、尿素分解和需氧化學(xué)異養密切正相關(guān)。
RDA圖顯示,37個(gè)屬和環(huán)境變量可分為四個(gè)部分,由矩形軸分隔(圖4C)。在第一象限中,磷酸鹽、DOC和碳酸鹽主要與B9、B6和B3有關(guān)。在第二象限,硫酸鹽主要與B14和B26屬有關(guān)。在第三象限中,B17、B18、B16和B7主要與ORP相關(guān),與pH呈負相關(guān)。在第四象限中,銨主要與B2、B19和B4屬相關(guān)。AVS主要與B20相關(guān)。
一般來(lái)說(shuō),各種化合物,如氨、硝酸鹽、硫酸鹽、有機污染物和金屬離子,共存于受污染的沉積物中。其中一些可以用作天然微生物的電子受體或供體。在本研究中,環(huán)境條件與SPC劑量之間的線(xiàn)性關(guān)系(圖1a和表S1)表明,SPC添加量越高,導致溶解物質(zhì)增加,并降低受污染沉積物中的ORP。此外,水生生態(tài)系統中的溶解有機物含有氧化還原活性部分;ORP的下降表明溶解有機物的這些氧化還原部分被氧化,因為氧化部分具有還原電位Eh(Lau等人,2017)。這可能是部分氧化效應(De la Calle et al.,2012)和SPC的洗滌效應共同作用的結果。SPC通常被用作H2O2的來(lái)源,H2O2是一種強氧化劑,也是洗滌劑的主要成分(Zonfrilli et al.,2009)。此外,環(huán)境條件的后續變化,包括硫酸鹽還原率升高(圖1b-h)、AVS回收量(圖S1)、溶解有機物還原(圖S2)、有機酸生產(chǎn)(表S3)和ORP升高,這表明產(chǎn)生的氧化有機物和硫酸鹽被本地微生物群落利用。此外,AWCD結果(圖2)表明,微生物群落的不同代謝活性已增強。此外,在不同時(shí)期,代謝活動(dòng)增強(雜項和碳水化合物,圖2B)和功能微生物份額增加(硫酸鹽呼吸和發(fā)酵,圖3E),表明激活的微生物呼吸僅在實(shí)驗開(kāi)始時(shí)保持,并且在整個(gè)實(shí)驗過(guò)程中發(fā)酵得到增強??傊?,這些結果表明,添加SPC可間接提供電子受體或供體,以改善污染沉積物中微生物的代謝活性。這是一個(gè)有利于降低生態(tài)工程成本的策略,特別是對于原位生物修復。
近年來(lái),由于非培養方法的快速發(fā)展,微生物群落結構的研究受到了前所未有的重視。微生物群落在分類(lèi)組成上表現出強烈的差異,而其代謝功能和性能可能保持不變(Louca和Doebeli,2017)。因此,徹底調查微生物群落對添加SPC的反應需要對分類(lèi)組成和功能分析進(jìn)行共同解釋。獲得的阿爾法多樣性結果(表1)表明,在SPC的H劑量下,微生物群落的異質(zhì)性可能會(huì )下降。獲得的分類(lèi)學(xué)水平結果表明,在SPC的H劑量下顯著(zhù)增加的微生物主要屬于厚壁菌門(mén)(其中許多產(chǎn)生內孢子(Onyenwake et al.,2004)),專(zhuān)性厭氧類(lèi)梭狀芽孢桿菌(川崎等,1998年)、發(fā)酵類(lèi)Petrimonas屬(Grabowski等,2005年)和蛋白水解類(lèi)Proteinicreticum屬(Zhang等,2010年)。此外,在M劑量SPC下增加的微生物主要屬于α蛋白細菌類(lèi)(在有機富集沉積物中對有機物的分解和同化具有重要作用的細菌(Kunihiro等人,2011))和異養菌屬Brevundimonas(Tsubouchi等人,2014)。相比之下,嗜酸性細菌門(mén)、Caldisericia類(lèi)(硫代硫酸鹽還原菌(Mori et al.,2009))、Holophagae(其成員能夠厭氧降解芳香化合物(Anderson et al.,2012))、硫氧化菌屬Sulfuricurvum(Haaijer et al.,2008;Kodama和Watanabe,2004),鞘氨醇桿菌科的一個(gè)屬(Schmidt et al.,2012)是SPC M和H劑量下最脆弱的微生物。受影響的微生物群落在更高的分類(lèi)水平(如類(lèi)群或門(mén)水平)表現出與屬水平相似的重疊和分類(lèi)豐度,這表明SPC的加入可能會(huì )影響特定狹窄分支內的特定屬。此外,在整個(gè)實(shí)驗期間,所有這些效應很難自發(fā)恢復到原始狀態(tài)。關(guān)于功能性基團,獲得的結果(圖3E和表S4)表明,在所有試驗期間,在M和H劑量的SPC下,最豐富的基團沒(méi)有改變,對發(fā)酵、化學(xué)異養、尿解和需氧化學(xué)異養的影響都是積極的。然而,在試驗后期,H劑量對硫酸鹽呼吸和硫化物呼吸的影響為負。這些發(fā)現表明,微生物群落的分類(lèi)組成和功能組對添加SPC的反應均表現出劑量依賴(lài)性偏差。這表明在生態(tài)工程中應考慮SPC的劑量。
先前的研究報告了地球化學(xué)成分變化與群落結構變化之間的顯著(zhù)相關(guān)性(Jorgensen等人,2012年;Louca等人,2017年)。在本研究中,改變的環(huán)境變量、顯著(zhù)增加的微生物組和功能性微生物的優(yōu)勢之間的強相關(guān)性(圖4)表明,添加SPC后,DOC、碳酸鹽和磷酸鹽是主要變量,富集了特定的微生物,脆弱的微生物組群歸因于ORP。然而,除了顯著(zhù)增加的微生物與上述功能微生物之間的相關(guān)性外,之前的研究報告稱(chēng),Petrimonas是產(chǎn)氫細菌(Sun等人,2015),脫氮系統中的蛋白碎屑菌通常非常豐富(Wang等人,2015;Yang等人,2015),柴油中發(fā)現了Brevundimonas(Wang等人,2016)。此外,雜項組的代謝活動(dòng)增強(圖2b)。很可能,增加的屬可能具有不同的代謝能力,并可能參與沉積物修復中污染物的后續生物修復。
環(huán)境變量和微生物群落對污染沉積物中添加過(guò)碳酸鈉的響應——摘要、介紹
環(huán)境變量和微生物群落對污染沉積物中添加過(guò)碳酸鈉的響應——材料和方法
環(huán)境變量和微生物群落對污染沉積物中添加過(guò)碳酸鈉的響應——結果和討論
環(huán)境變量和微生物群落對污染沉積物中添加過(guò)碳酸鈉的響應——結論、致謝!